中国科学学与科技政策研究会，数字创新与管理专委会副主任委员；（第七、第八届理事）；江苏省科学学与科研管理研究会副秘书长，常务理事（第八届）；国际学术会议组织Society of Open Innovation(SOI)副主席。
近年主持的主要课题：
[1]工信部课题（课题执笔人）：新一代人工智能赋能制造业数字化转型关键路径研究；2024.03-2024.12；在研。
[2]江苏省2023年重点智库研究课题（课题执笔人）：培育江苏数据产业生态关键路径研究；2023.06-2023.12；结题。
[3]中国科协创新战略研究院重点项目（课题负责人）：国内外数字经济关键技术应用研究；课题号2022-sjzx-02，2022.05-2022.12；结题。
[4]江苏省科技厅计划专项资金项目（课题执笔人）：数字赋能传统制造业转型升级的关键路径研究——以常熟产创融合实践为例；2022.06-2023.05；结题。
[5]江苏省工业和信息化厅重点课题（课题执笔人）：江苏制造业数字化转型实践研究；2022.07-2023.12；结题。
[6]江苏省政府决策咨询研究重点课题及江苏省社会科学基金项目（课题执笔人）：江苏加快数字经济核心产业发展对策研究；课题号JSZY202202、22JZA002，2022.06-2022.12；结题。
[7]江苏省哲学社会科学界联合会项目（课题负责人）: 新时期江苏创新驱动发展机制研究——基于创新生态系统视角；课题号21SSL099，2021.12-2022.5,结题。
[8]2021年省委网信办重点研究课题服务项目（课题负责人）:信息化在“四化”同步集成改革中支撑引领作用发挥研究；课题号JSZC-320000-XDFH-C2021-0006 ，2021.08-2021.11,结题。
[9]江苏省哲学社会科学界联合会项目（课题负责人）长三角城市群创新共同体加快科技成果转化运行机制研究；课题号20SS1028，2020.5-2020.12，结题。
[10]江苏省哲学社会科学界联合会项目（课题负责人）：培育面向全球的、竞争力强的江苏省创新生态系统研究；课题号19SSL086，2019.12-2020.6，结题。
[11]江苏省哲学社会科学界联合会项目（课题负责人）：打造江苏知识产权运营生态平台关键路径及政策研究——基于创新生态视角；课题号18SSL045，2018.8 -2018.12，结题。
[12]江苏省哲学社会科学界联合会项目（课题负责人）：“互联网+”环境下江苏创新生态系统培育政策研究；2015.8 -2015.12，结题。
[13]国家自然科学基金面上项目（课题负责人）：技术惯域对企业持续创新的作用机制及转化模式研究；课题号：No.71272164，2013.1 -2016.12
[1] Lei Ma., Ben Zhang., Kaitong Liang., Yang Cheng., Chaonan Yi. (2024). Digital enabled innovation ecosystems: a dual case study of knowledge flows in intellectual property platforms. European Journal of Innovation Management, DOI 10.1108/EJIM-07-2023-0610. （SSCI收录）
[2] 余江,马蕾,张越.产业智能化：理论机制与中国实践探索[J].创新科技,2024, 24(01):1-7. DOI:10.19345/j.cxkj.1671-0037.2024.1.1.（通讯作者）
[3] Liang K, Ma L, Liu Z, Yi C.(2023). Successfully operating patent digital platforms in China: A configurational perspective. Managerial and Decision Economics, DOI:10.1002/mde.3966.（SSCI收录，通讯作者)
[4] Yi, C., Ma, L., Liu, Z., Liang, K., & Huang, X. (2023). Cultivating Regional Innovation Ecosystems in the Digital Age: Case Studies of Four Cites in China. Science, Technology and Society. 2023, 28(2), 191–212. DOI: 10.1177/09717218231160425（SSCI收录，通讯作者)
[5] JinHyo Joseph Yun, Xiaofei Zhao, Lei Ma, Zheng Liu & Bo Yang (2022). Open innovation dynamics and evolution in the mobile payment industry – comparative analysis among Daegu, Cardiff, and Nanjing, European Planning Studies, DOI: 10.1080/09654313.2022.2132784
[6] Liang K, Ma L, Liu Z, Li T. Structuring and Operating Patent Intermediary as Platform Ecosystem: Case Studies of Patent Operation Platforms (POPs) in China. Science, Technology and Society. 2022;27(2):191-212.( SSCI收录)
[7]马蕾,梁凯桐等.数字技术驱动下中国知识产权运营平台发展历程及演化趋势研究[J].中国科技论坛, 2021(10):153-161. （CSSCI收录）
[8] Lei Ma, Zheng Liu, Xiaojing Huang, Tao Li.(2019)“The Impact of Local Government Policy on Innovation Ecosystem in Knowledge Resource Scarce Region: Case Study of Changzhou, China”, Science, Technology & Society, 24(1):1-24（SSCI收录）.
[9] Jun Jin, Lei Ma & Xinwei Ye. (2019). Digital transformation strategies for existed firms: from the perspectives of data ownership and key value propositions, Asian Journal of Technology Innovation, 28(3):1-17.（SSCI收录）.
[10]刘鑫,马蕾.基于专利偏好与项目合作测度的中国技术产业化研究[J].情报杂志,2017,09:45-50.（CSSCI收录）
马蕾（独立作者，专著）：打开持续创新的“黑箱”——基于组织惯域的思考[M]，北京，知识产权出版社，2017.5